Já aconteceu comigo umas três vezes e eu tive que formatar para resolver.
Quando eu clico para abrir um arquivo ou mesmo para salvar ele não abre a janela do windows para eu selecionar o diretório ou o nome do arquivo, ele mostra uma linha de comando para eu inserir o caminho como se fosse no DOS.
É um pé no saco ter que fazer isso, alguém sabe como é que resolve sem ter que formatar.
Aconteceu novamente quando instalei o Update 3 (Civil 3D 2010).